渔业信息工程中心成立于2008年，现有研究及技术人员共25人。其中，固定研究人员11人，技术聘用人员14人，拥有院信息工程功能实验室、中国渔政管理指挥系统运维组以及渔业防灾减灾监测数据分站等实体部门，形成一支具备研究基础与研发经验的信息化研究队伍。

渔业信息工程中心以我国渔业经济发展和学科发展趋势为基本点，以推动产业发展，强化信息应用支撑为导向，面向国家渔业重大战略需求，面向世界科技前沿，依托重大科研项目开展应用基础研究与技术创新，重点在渔业资源建设与共享服务、渔船渔港数字化关键技术应用、渔业管理信息化与信息安全保障战略等领域开展应用基础研究、技术创新、模式集成与示范推广，推动信息技术创新与其他学科发展创新的有机结合，促进渔业产业发展向创新驱动型转变。

近年来，中心先后承担各类科研项目20余项，取得科技奖励2项，发表学术文章及相关专利50余项。同时，中心积极开展科研项目储备库建设与科技支撑服务工作，全力抓好技术研究和成果产出，完善技术和人才储备，学科发展方向与渔业产业经济发展联系紧密，信息支撑与科技服务作用日益凸显。